洪都拉斯西北部交通运输业比较发达，而内陆山区和东北沿海地区交通闭塞，物资流通主要依靠牲畜。全国有3条铁路，总长1780千米，集中在北部沿海地区，其中一部分为香蕉和甘蔗专用运输线。特古西加尔巴四周群山陡峭，与外界的交通运输主要靠公路和航空。公路总长18 494 千米。主要有连接特古西加尔巴和圣佩德罗苏拉的"南北公路"和连接洪都拉斯与萨尔瓦多、尼加拉瓜且与太平洋平行的"泛美公路"。南北均有海港，主要港口有科尔特斯、特拉、塞巴、特鲁希略和圣洛伦索。其中科尔特斯为全国最大港口，承担了全国出口贸易的一半。各大港口同国际海运公司都保持着正常的服务性联系。有4个国际机场。